آزمایش HPV با PCR چه چیزی را بررسی میکند؟
در آزمایش مولکولی HPV، DNA یا در برخی روشها RNA ویروس در نمونه بررسی میشود. روشهای مبتنی بر PCR میتوانند وجود HPVهای پرخطر را شناسایی کنند و بسته به نوع کیت یا پلتفرم، بعضی ژنوتیپها را نیز بهصورت اختصاصی گزارش دهند.
آزمایش مولکولی HPV چیست؟
ویروس پاپیلومای انسانی یا HPV را نمیتوان مانند بسیاری از باکتریها با روشهای معمول کشت آزمایشگاهی شناسایی کرد. برای تشخیص مستقیم ویروس، روشهای مولکولی که اسید نوکلئیک HPV را شناسایی میکنند اهمیت اصلی دارند. بسیاری از تستهای امروزی بر پایه amplification اسید نوکلئیک و از جمله PCR طراحی شدهاند.

هدف آزمایش بسته به نوع assay میتواند متفاوت باشد. برخی تستها تنها وجود یا عدم وجود گروهی از HPVهای پرخطر را گزارش میکنند، در حالی که برخی دیگر قادر به شناسایی ژنوتیپهای مشخص یا گروهبندی ژنوتیپها بر اساس سطح خطر هستند.
بنابراین اصطلاح «آزمایش HPV» به یک روش واحد اشاره نمیکند و نوع نمونه، ناحیه ژنومی هدف، ژنوتیپهای قابل شناسایی و نحوه گزارش نتیجه به کیت و پلتفرم مورد استفاده بستگی دارد.
چه نمونههایی برای آزمایش HPV استفاده میشوند؟
در غربالگری سرطان دهانه رحم، مهمترین نمونه، سلولهای جمعآوریشده از ناحیه سرویکس است. در بعضی سیستمهای معتبر، نمونه واژینال خودجمعآوریشده نیز قابل استفاده است.
راهنمای WHO استفاده از نمونه جمعآوریشده توسط ارائهدهنده خدمات سلامت یا نمونه self-collected را برای HPV DNA testing در برنامههای مناسب غربالگری مطرح کرده است. همچنین تعدادی از سیستمهای مولکولی جدید برای نمونه واژینال خودجمعآوریشده نیز اعتبارسنجی و تأیید شدهاند.
نکته مهم این است که هر نوع نمونهای را نمیتوان با هر کیتی آزمایش کرد. نوع swab یا brush، محیط انتقال، روش نگهداری و نوع نمونه باید در محدوده عملکرد و اعتبارسنجی assay مورد استفاده قرار داشته باشد.
در کاربردهای پژوهشی یا تشخیصی خاص ممکن است نمونههای بافتی نیز مورد بررسی مولکولی قرار گیرند، اما نتایج assayهای غربالگری سرویکس را نباید بدون اعتبارسنجی به نمونههای دهانی، مقعدی یا سایر نمونهها تعمیم داد.
مرحله Pre-analytical در آزمایش HPV
بخش قابلتوجهی از خطاهای آزمایش مولکولی میتواند قبل از شروع PCR ایجاد شود. کیفیت نمونه، تعداد مناسب سلولها، روش انتقال و شرایط نگهداری همگی میتوانند بر نتیجه نهایی اثر بگذارند.
در مرحله پیشتحلیلی باید به هویت صحیح نمونه، نوع ظرف و محیط انتقال، زمان انتقال به آزمایشگاه، شرایط نگهداری و تطابق نمونه با الزامات کیت توجه شود.
نمونهای که مقدار کافی ماده سلولی نداشته باشد ممکن است از نظر HPV منفی گزارش شود، در حالی که مشکل اصلی کیفیت نامناسب نمونه بوده است. به همین دلیل وجود کنترل داخلی مناسب در تستهای مولکولی اهمیت زیادی دارد.
برای دما و مدت نگهداری نیز نباید یک عدد ثابت برای تمام تستهای HPV ارائه کرد؛ شرایط صحیح باید از دستورالعمل سازنده همان سیستم استخراج شود.
استخراج DNA در آزمایش HPV
در تستهای HPV DNA، پس از آمادهسازی نمونه باید اسید نوکلئیک قابل استفاده برای amplification فراهم شود.
فرآیند استخراج بهطور کلی شامل آزادسازی DNA از سلولها، حذف یا کاهش ترکیبات مزاحم و تهیه DNA با کیفیت مناسب برای واکنش مولکولی است. در سیستمهای مختلف این فرآیند میتواند بهصورت دستی، نیمهاتوماتیک یا کاملاً اتوماتیک انجام شود.
وجود DNA زیاد بهتنهایی تضمینکننده نتیجه مناسب نیست؛ خلوص نمونه و نبود مهارکنندههای PCR نیز اهمیت دارد.
در پلتفرمهای تجاری ممکن است استخراج DNA و مراحل amplification در یک workflow خودکار انجام شوند و کاربر مستقیماً DNA استخراجشده را مشاهده نکند.

تشخیص HPV با PCR چگونه انجام میشود؟
در PCR، بخش مشخصی از ژنوم HPV توسط پرایمرها هدف قرار میگیرد و در صورت وجود توالی هدف، طی فرآیند amplification تکثیر میشود.
منطقه ژنومی هدف در تستهای مختلف یکسان نیست. برخی assayها نواحی خاصی از DNA ویروس را هدف میگیرند و برخی سیستمهای RNA-based نیز بیان ژنهای ویروسی را بررسی میکنند. بنابراین نمیتوان یک ژن یا یک جفت پرایمر را بهعنوان هدف عمومی تمام تستهای HPV معرفی کرد.
پس از amplification، نحوه شناسایی محصول نیز به روش مورد استفاده بستگی دارد.
Conventional PCR
- در PCR معمولی، amplification انجام شده و محصول معمولاً در یک مرحله جداگانه بررسی میشود. این رویکرد در تحقیقات و برخی روشهای آزمایشگاهی کاربرد دارد، اما استفاده بالینی از هر روش PCR نیازمند اعتبارسنجی مناسب است.
- یکی از محدودیتهای مهم Conventional PCR این است که باز کردن تیوبهای حاوی محصول PCR برای مراحل بعدی میتواند خطر آلودگی آزمایشگاه با Amplicon را افزایش دهد.
Real-Time PCR
- در Real-Time PCR تشکیل محصول amplification همزمان با واکنش پایش میشود. استفاده از پروبها و طراحی Multiplex امکان شناسایی چند Target را در یک واکنش فراهم میکند.
- بسیاری از سیستمهای تجاری HPV از Real-Time PCR یا روشهای مولکولی خودکار مشابه استفاده میکنند تا HPVهای پرخطر و در برخی موارد ژنوتیپهای مشخص را گزارش دهند.
- مزیت اصلی این روش، کاهش مراحل post-PCR، قابلیت اتوماسیون و امکان استفاده از کنترلهای متعدد در یک سیستم بسته است.
آیا Ct در آزمایش HPV نشاندهنده Viral Load است؟
در Real-Time PCR معمولاً مقداری مانند Ct یا Cq تولید میشود؛ اما نباید Ct را بدون اعتبارسنجی به Viral Load تبدیل کرد.
Ct تحت تأثیر عوامل متعددی مانند مقدار نمونه اولیه، تعداد سلولهای جمعآوریشده، راندمان استخراج، طراحی assay و عملکرد واکنش قرار میگیرد.
اگر یک کیت صرفاً بهعنوان تست کیفی تأیید شده باشد، هدف آن گزارش Positive یا Negative است. پایینتر بودن Ct الزاماً به معنای «شدت بیشتر بیماری» یا «خطر بیشتر سرطان» نیست.
برای گزارش کمی بار ویروسی، سیستم باید مشخصاً برای Quantification طراحی و اعتبارسنجی شده باشد.
HPV Genotyping چیست؟
HPV Genotyping یعنی تعیین اینکه کدام ژنوتیپ یا گروه ژنوتیپی HPV در نمونه شناسایی شده است.
این موضوع در تست HPV اهمیت زیادی دارد، زیرا همه ژنوتیپها از نظر خطر ایجاد ضایعات پیشسرطانی و سرطان یکسان نیستند.
WHO در راهنمای بهروز سال ۲۰۲۶، استفاده از HPV DNA Genotyping را بهعنوان ابزاری برای Risk Stratification و Molecular Triage بررسی کرده و بین تستهای بدون Genotyping، Limited Genotyping و Extended Genotyping تمایز قائل شده است.
Limited Genotyping
- در Limited Genotyping معمولاً HPV16 و HPV18 بهصورت جداگانه شناسایی میشوند و سایر HPVهای پرخطر بهصورت یک یا چند گروه گزارش میشوند.
- این مدل گزارش به آزمایشگاه و سیستم غربالگری امکان میدهد افرادی را که ژنوتیپهای دارای ریسک بالاتر دارند از سایر موارد HPV-positive تفکیک کند.
Extended Genotyping
- در Extended Genotyping اطلاعات بیشتری درباره ژنوتیپهای پرخطر ارائه میشود. بسته به سیستم، بعضی ژنوتیپها ممکن است جداگانه و برخی در گروههای خطر گزارش شوند.
- راهنمای WHO در سال ۲۰۲۶ استفاده از Genotyping گستردهتر را بهعنوان یکی از ابزارهای بالقوه برای دستهبندی خطر و مدیریت هدفمندتر موارد HPV-positive بررسی کرده است.
چرا HPV16 و HPV18 اهمیت ویژهای دارند؟
- در بسیاری از الگوریتمهای غربالگری و پلتفرمهای مولکولی، HPV16 و HPV18 بهصورت جداگانه گزارش میشوند.
- دلیل این تفکیک آن است که ژنوتیپهای مختلف HPV از نظر خطر ایجاد ضایعات پیشسرطانی و سرطان دهانه رحم یکسان نیستند. WHO نیز در تعریف Limited Genotyping به شناسایی جداگانه HPV16/18 و گروهبندی سایر انواع پرخطر اشاره میکند.
- برخی پلتفرمهای جدید علاوه بر HPV16 و HPV18، ژنوتیپها یا گروههای دیگری از HPVهای پرخطر را نیز بهصورت جداگانه گزارش میکنند. نحوه گزارش باید دقیقاً مطابق محدوده عملکرد همان تست باشد.
High-Risk و Low-Risk HPV در گزارش آزمایشگاهی
از نظر بالینی، ژنوتیپهای HPV بر اساس ارتباط آنها با سرطان به گروههای مختلف تقسیم میشوند.
در غربالگری سرطان دهانه رحم تمرکز اصلی روی HPVهای پرخطر یا oncogenic HPV است. بسیاری از تستهای بالینی غربالگری برای شناسایی گروه مشخصی از HPVهای پرخطر طراحی شدهاند.
بنابراین Negative شدن یک High-Risk HPV assay لزوماً به معنی عدم وجود هر نوع HPV در بدن نیست؛ بلکه به این معناست که اهداف مشخصشده توسط همان assay در نمونه شناسایی نشدهاند.
همین نکته باید در تفسیر نتیجه و حتی طراحی متن گزارش آزمایشگاهی در نظر گرفته شود.
کنترلهای ضروری در آزمایش HPV
یک نتیجه PCR بدون کنترل مناسب ارزش محدودی دارد. سیستم کنترل باید بتواند خطاهای احتمالی در amplification، آلودگی و در صورت طراحی مناسب، مشکلات نمونه یا استخراج را آشکار کند.
- کنترل مثبت نشان میدهد سیستم قادر به شناسایی Target موردنظر است.
- کنترل منفی یا NTC برای بررسی آلودگی واکنش و محیط اهمیت دارد. مثبت شدن کنترل منفی میتواند نشاندهنده Contamination باشد و Run باید بر اساس معیارهای پذیرش سیستم بررسی شود.
- Internal Control یکی از مهمترین اجزای تست است. بسته به طراحی assay، این کنترل میتواند عملکرد استخراج، وجود ماده سلولی مناسب، amplification و وجود مهارکنندهها را پایش کند.
نوع Internal Control در تمام کیتها یکسان نیست؛ بنابراین نحوه تفسیر آن باید بر اساس IFU یا روش اعتبارسنجیشده آزمایشگاه انجام شود.
جلوگیری از آلودگی در PCR آزمایش HPV
- یکی از مهمترین خطاهای فنی در آزمایشگاههای PCR، انتقال Amplicon از واکنشهای قبلی به نمونههای جدید است.
- طراحی Workflow یکطرفه، جداسازی فضاهای Pre-PCR و Post-PCR، استفاده از وسایل اختصاصی هر بخش و رعایت روش صحیح تمیزکاری میتواند احتمال Contamination را کاهش دهد.
- Master Mix، نمونه استخراجشده و محصولات Amplification نباید بدون کنترل مناسب در یک فضای کاری مشترک پردازش شوند.
- در سیستمهای Closed Real-Time PCR خطر آلودگی post-amplification کمتر است، زیرا معمولاً برای مشاهده نتیجه نیازی به باز کردن تیوب پس از PCR وجود ندارد.
تفسیر نتیجه HPV PCR
HPV Positive
- نتیجه مثبت یعنی اسید نوکلئیک HPV هدفِ مورد بررسی در نمونه شناسایی شده است.
- HPV Positive به معنی سرطان نیست
- حتی شناسایی HPV پرخطر نیز بهتنهایی وجود ضایعه پیشسرطانی یا سرطان را اثبات نمیکند. نتیجه باید بر اساس نوع آزمایش، ژنوتیپ، سابقه غربالگری و الگوریتمهای بالینی معتبر پیگیری شود.
- WHO از HPV testing بهعنوان تست اصلی غربالگری حمایت میکند، اما مدیریت یک نتیجه مثبت میتواند شامل Genotyping، Cytology، Colposcopy یا سایر روشهای Triage باشد.
HPV Negative
- نتیجه منفی یعنی Targetهای HPV تعریفشده برای آن assay در نمونه و در محدوده تشخیص تست شناسایی نشدهاند.
- نتیجه منفی به معنی این نیست که فرد در تمام طول زندگی HPV نداشته یا در آینده به آن مبتلا نخواهد شد.
- همچنین کیفیت نامناسب نمونه، مقدار بسیار کم Target یا وجود مهارکنندهها میتواند بر نتیجه تأثیر بگذارد؛ به همین دلیل Valid بودن کنترل داخلی اهمیت زیادی دارد.
Invalid Result
- اگر کنترلهای مورد انتظار عملکرد صحیح نداشته باشند، نتیجه ممکن است Invalid گزارش شود.
- این وضعیت میتواند ناشی از مهار PCR، مشکل استخراج، کیفیت نامناسب نمونه، خطای دستگاه یا سایر مشکلات فنی باشد.
- در این شرایط نباید نتیجه Invalid را Negative در نظر گرفت.
علت False Negative در تست HPV چیست؟
- منفی کاذب میتواند به دلایل مختلفی رخ دهد؛ از جمله نمونهگیری نامناسب، تعداد کم سلولها، مقدار پایین DNA ویروس، تخریب اسید نوکلئیک، وجود مهارکننده PCR یا عدم پوشش ژنوتیپ موردنظر توسط assay.
- همچنین شرایط نامناسب حمل و نگهداری نمونه میتواند کیفیت آن را کاهش دهد.
- وجود Internal Control مناسب و رعایت الزامات Pre-analytical نقش مهمی در کاهش احتمال گزارش نتایج نامعتبر یا منفی کاذب دارد.
علت False Positive چیست؟
- آلودگی نمونه یا واکنش با DNA حاصل از نمونه یا Ampliconهای دیگر یکی از مهمترین علل فنی نتیجه مثبت کاذب است.
- در کنار آن، ویژگیهای اختصاصیت هر assay و Cross-Reactivity احتمالی نیز باید در فرایند اعتبارسنجی در نظر گرفته شوند.
- اما یک نکته مهم این است که HPV مثبت بدون وجود ضایعه سرطانی، False Positive محسوب نمیشود. آزمایش HPV حضور ویروس یا Target مولکولی آن را بررسی میکند، نه وجود سرطان.
- ممکن است یک عفونت HPV واقعی و قابل تشخیص باشد ولی در فرد هیچ ضایعهای وجود نداشته باشد.
تفاوت HPV PCR و Pap Smear چیست؟
HPV molecular testing و Pap smear دو سؤال متفاوت را پاسخ میدهند.
در آزمایش مولکولی HPV، وجود اسید نوکلئیک ویروس بررسی میشود؛ اما در Pap smear یا Cytology، شکل و ویژگیهای سلولهای جمعآوریشده از سرویکس از نظر تغییرات غیرطبیعی ارزیابی میشوند.
به همین دلیل:
- HPV Test = آیا HPV پرخطر هدف در نمونه وجود دارد؟
- Pap Smear = آیا تغییرات سلولی غیرطبیعی دیده میشود؟
این دو روش میتوانند بسته به الگوریتم غربالگری بهصورت مستقل یا مکمل یکدیگر استفاده شوند.
امروزه WHO، HPV testing با عملکرد بالا را روش ترجیحی غربالگری اولیه در برنامههای پیشگیری از سرطان دهانه رحم میداند.
کنترل کیفیت در آزمایش HPV
کنترل کیفیت تست HPV تنها به وجود Positive و Negative Control در هر Run محدود نمیشود.
آزمایشگاه باید مراحل Pre-analytical، Analytical و Post-analytical را در کنار هم مدیریت کند. معیارهای پذیرش و رد نمونه، بررسی عملکرد کنترلها، پایش آلودگی، صحت عملکرد تجهیزات، کنترل Lot جدید معرفها و ثبت نتایج QC از اجزای مهم یک سیستم قابل اعتماد هستند.
در صورت استفاده از روش In-house یا Laboratory-Developed Test، موضوع Validation اهمیت بیشتری پیدا میکند و پارامترهایی مانند Analytical Sensitivity، Specificity، Limit of Detection، Reproducibility و Cross-Reactivity باید متناسب با کاربرد روش بررسی شوند.
برای سیستمهای تجاری نیز استفاده خارج از نوع نمونه، ژنوتیپها یا کاربرد تعریفشده توسط سازنده بدون Validation مناسب میتواند اعتبار نتیجه را کاهش دهد.
گزارش آزمایش HPV باید چه اطلاعاتی داشته باشد؟
یک گزارش مناسب باید مشخص کند چه چیزی واقعاً توسط تست اندازهگیری شده است.
نام روش یا پلتفرم، نوع نمونه، نتیجه High-Risk HPV، نتیجه ژنوتیپها در صورت انجام Genotyping و وضعیت معتبر بودن تست باید بهصورت شفاف ارائه شود.
برای مثال، اگر assay فقط HPV16، HPV18 و یک Pool از سایر High-Risk HPVها را تفکیک میکند، گزارش نباید وانمود کند که ژنوتیپ دقیق تمام نمونههای مثبت مشخص شده است.
همچنین بهتر است محدوده تشخیصی assay یا ژنوتیپهای تحت پوشش در گزارش، SOP یا اطلاعات همراه نتیجه قابل دسترس باشد.
در تستهای کیفی نیز گزارش Ct بهتنهایی بدون تفسیر سازنده یا Validation آزمایشگاه ممکن است برای پزشک یا بیمار گمراهکننده باشد.
یک Workflow استاندارد آزمایشگاهی HPV چگونه است؟
فرآیند از دریافت یک نمونه معتبر و قابل ردیابی شروع میشود. پس از بررسی معیارهای پذیرش نمونه، ماده ژنتیکی مطابق روش معتبر استخراج یا توسط سیستم اتوماتیک آماده میشود.
در مرحله بعد amplification در حضور کنترلهای موردنیاز انجام میشود. نرمافزار یا روش تفسیر، Targetهای شناساییشده و وضعیت کنترلها را بررسی میکند.
تنها در صورتی که معیارهای QC پذیرفته باشند باید نتیجه Positive، Negative یا Genotype-specific گزارش شود.
در نهایت نتیجه آزمایش مولکولی باید در محدوده Intended Use همان تست تفسیر شود و تصمیمگیری بالینی به الگوریتم غربالگری و شرایط بیمار وابسته است.
آیا Conventional PCR برای آزمایش HPV کافی است؟
- از نظر پژوهشی میتوان HPV را با روشهای مختلف PCR شناسایی کرد، اما استفاده بالینی از یک PCR صرفاً به این دلیل که باند مورد انتظار ایجاد میکند کافی نیست.
- یک تست تشخیصی باید از نظر حساسیت، اختصاصیت، Limit of Detection، Reproducibility، کنترلهای داخلی و سازگاری با نوع نمونه مورد نظر ارزیابی شده باشد.
- به همین دلیل CDC نیز تأکید میکند که تشخیص HPV به روشهای مولکولی وابسته است و عملکرد هر assay باید با نوع نمونه و کاربرد بالینی آن مطابقت داشته باشد.
جمعبندی
- آزمایش HPV یک تست مولکولی ساده با پاسخ صرفاً «مثبت یا منفی» نیست. کیفیت نتیجه از مرحله نمونهگیری آغاز میشود و به استخراج مناسب اسید نوکلئیک، عملکرد PCR، کنترلهای کیفی، محدوده ژنوتیپهای تحت پوشش و تفسیر صحیح نتیجه وابسته است.
- در تستهای جدید HPV، Genotyping نقش مهمتری در دستهبندی خطر پیدا کرده است. راهنمای WHO در سال ۲۰۲۶ نیز استفاده از Limited و Extended HPV DNA Genotyping را بهعنوان بخشی از رویکردهای جدید غربالگری و Triage بررسی کرده است.
- مهمترین اصل برای آزمایشگاه این است که نتیجه دقیقاً در محدوده عملکرد assay گزارش شود: HPV-positive مساوی سرطان نیست، HPV-negative نیز تنها درباره Targetهای بررسیشده در همان نمونه و همان زمان اطلاعات میدهد.
سوالات متداول آزمایش HPV با PCR
Real-Time PCR بهتر از PCR معمولی است؟
برای بسیاری از کاربردهای تشخیصی، Real-Time PCR به دلیل سیستم بسته، کاهش مراحل post-PCR، قابلیت Multiplex و امکان اتوماسیون مزایایی دارد. با این حال، کیفیت یک تست به Validation کل assay بستگی دارد و تنها Real-Time بودن روش تضمینکننده کیفیت نیست.
آیا با PCR میتوان نوع HPV را مشخص کرد؟
بله، اگر assay برای Genotyping طراحی شده باشد. برخی تستها HPV16 و HPV18 را جداگانه گزارش میکنند و سایر انواع پرخطر را بهصورت گروهی نشان میدهند؛ برخی سیستمها نیز Genotyping گستردهتری ارائه میکنند.
HPV مثبت یعنی سرطان؟
خیر. نتیجه مثبت نشاندهنده شناسایی HPV هدف در نمونه است. وجود سرطان یا ضایعات پیشسرطانی باید با روشها و الگوریتمهای بالینی مناسب ارزیابی شود.
آیا Ct پایینتر یعنی HPV شدیدتر است؟
نه لزوماً. در یک تست HPV کیفی، Ct را نباید مستقیماً به شدت عفونت، بار ویروسی یا خطر سرطان تبدیل کرد مگر اینکه روش بهطور مشخص برای Quantification اعتبارسنجی شده باشد.
چرا Internal Control در تست HPV مهم است؟
کنترل داخلی میتواند به شناسایی مشکلاتی مانند نقص استخراج، مهار amplification یا در برخی طراحیها کیفیت ناکافی نمونه کمک کند. Negative بودن HPV در حالی که Internal Control معتبر نیست، نباید بهعنوان یک نتیجه منفی معتبر تفسیر شود.
آیا نمونه Self-Collection برای HPV قابل استفاده است؟
بله، در برنامهها و assayهایی که برای این نوع نمونه اعتبارسنجی شدهاند. WHO استفاده از نمونههای self-collected را در HPV DNA screening مطرح کرده و چندین سیستم مولکولی نیز برای نمونه واژینال خودجمعآوریشده تأیید شدهاند.
منابع علمی اصلی:
- World Health Organization. *WHO guideline for screening and treatment of cervical pre-cancer lesions for cervical cancer prevention: use of HPV DNA genotyping.* 2026.
- World Health Organization. *Evidence-informed guidance for the implementation of HPV-based cervical cancer screening programmes.* 2026.
- Centers for Disease Control and Prevention. *Human Papillomavirus – Laboratory Testing.* 2026.
- U.S. Food and Drug Administration. Current HPV molecular assay approvals and specimen indications.

